În anul 2012, în Republica Moldova cheltuielile Bugetului Public Național (BPN) pentru ocrotirea sănătății au fost de peste 4,7 miliarde lei, sau 13,5% din BPN (comparativ cu 10,9% în 2005), și 5,4% din Produsul Intern Brut (comparativ cu 4,2% în 2005). Tot în aceeași perioadă, pentru serviciile legate de asigurarea obligatorie de asistență medicală au fost cheltuiți 83% din totalul alocărilor pentru sănătate din BPN (peste 3,9 miliarde lei). Pentru categoriile „Servicii și instituții sanitaro-epidemiologice și de profilaxie” și „Programe naționale de ocrotire a sănătății” au fost cheltuiți 5,1% și respectiv 3,1%.
În clasamentul cheltuielilor publice pentru sănătate, Republica Moldova cheltuie mai mult decât țările vecine România și Ucraina (ambele 4,4% în 2010), dar mai puțin decât media pe țările Organizației pentru Cooperare și Dezvoltare Economică (OCDE) și țările Uniunii Europene, 8,2% și 8,1% respectiv. Totodată, în anul 2012, Republica Moldova se situa mai jos decât media pe OCDE și țările Uniunii Europene în ceea ce privește indicele sănătății al Programului Națiunilor Unite pentru Dezvoltare, cu 0.783 puncte față de 0.941 și 0.945, respectiv.